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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

浙江兰溪展出传承近900年棉毯 展现宋代纺织业水平******

　　中新网金华1月18日电 (张斌 董易鑫 陈志恒 朱彦轩)1966年8月，在当时的浙江省金华市兰溪县(现为兰溪市)香溪公社密山大队，人们发现了一座南宋墓葬，墓中出土一条棉毯——这是国内迄今为止发现最早、最完整的惟一一条南宋棉毯，距今已有近900年，现为国家一级文物。

　　1月18日，在“寻宋·一张南宋棉毯的故事”特展上，兰溪市博物馆相关负责人介绍，上述棉毯名为密山棉毯，长2.51米、宽1.16米，缝制了由81枚开元通宝和北宋钱币排列组成的6个互相连接的方胜纹图案。这条棉毯的出土有力证实了南宋时期，婺州(金华)一带特别是兰溪的棉纺织业达到很高的工艺水平，并改写了元代黄道婆带回棉纺织技术的历史，将棉纺织史向前推进了约100年。

　　据介绍，由于墓葬发现时间早，当地对于文物的保存条件不足，出土的棉毯及其他文物一直保存于浙江省博物馆。时隔56年，密山棉毯终于回到“家乡”兰溪，并在兰溪市博物馆展出。

　　“寻宋·一张南宋棉毯的故事”特展分为“他是谁”“何以不朽”“他们的日常”“棉毯之谜”四个篇章，共呈现62件(套)文物。特展将持续到今年3月。

　　特展开幕式上，兰溪市委书记戴翀表示，千年宋韵今犹在，一张棉毯照古今。透过密山棉毯，不仅可以一探八婺大地棉花种植史、棉纺织史，也可以串联起兰溪的水运交通史、商贸史及民俗风情史。

　　据兰溪市人民政府官网介绍，该市位于金华市西部，钱塘江中游，金衢盆地北部边缘。当地自古有“三江之汇”“六水之腰”“七省通衢”之称。

　　纺织业一直是当地传统优势主导和重要支柱产业。目前当地已形成较为完整的纺纱、织布、印染、色布、牛仔、家纺毛巾、服装、产业用布等一系列产业链，发展成为全国最具影响力的棉纺织面料生产基地之一，纯棉弹力休闲面料产量居全国前列。截至2021年，当地年产3.5亿米牛仔布，产量居全国之首，各类毛巾总产量居全国同级县市前列，被称为“中国织造名城”“中国纺织产业基地市”。

　　“纺织业是兰溪传统支柱产业，密山棉毯印证了兰溪纺织业的悠久历史、精湛技艺和重要地位，与兰溪打造‘智能织造示范地’的战略目标高度契合。此次密山棉毯展出及后续研讨，将进一步增强兰溪人的历史自信和文化自信，为兰溪纺织业更好更快发展提供文化支撑、凝聚思想共识，坚定再创辉煌的信心和决心。”戴翀说。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）